你的肠胃周期表是创造一种微生物群喂养粪便丸的下一步。-王其杉博客|程序员|科技新闻
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如果你患有像克罗恩那样的消化系统疾病,有一种最后的治疗方法:吃屎。这是一个令人不快的前景,这也是科学家们努力工作的原因,试图把粪便变成药丸。现在,如果一个医生想替换我们肠道中的细菌,那么就没有一种可以给你注射的药物或者你可以服用的药丸。相反,有一种程序被称为粪便微生物群移植(fmt)。这实际上是将粪便样本从健康人转移到病人身上——通常是通过口腔——这样“好的”细菌就可以转移到病人身上。在寻找替代品的竞争中,一组科学家建立了一个庞大的数据库,对我们肠道中的细菌进行分类。但是在你从粪便到药丸之前,你必须了解我们每个人体内的情况。科学家估计我们体内潜伏着大约400种独特的细菌。来自欧洲生物信息学研究所的Rob Finn和他的合作者由Wellcome Sanger研究所的Trevor Lawley领导,成功地分离出273种独立的细菌,其中包括173种以前从未测序过的细菌。这些数据构成了最初的数据集,这是一个正在进行中的关于所有潜伏在我们内脏中的生物的周期表。这项研究发表在《自然生物技术》杂志上,基于20个来自英国和加拿大的粪便样本,并可能导致真正的医学突破。在这些新物种中,艰难梭菌(clostridium difficile,简称c-diff)有几种分支类型,进一步的研究有一天可以帮助患有肠易激综合征和一系列其他疾病的人们。“我们认识每个人,或者我们开始了解每个人,”芬恩说,他把细菌当作人来看待。“我们正在建立数据库,一旦我们有了指纹,我们就可以使用更快的技术来了解下一个人的身份。”想想音乐应用程序shazam。它只听几秒钟的音乐,并将其与数百万首曲目的数据库进行比较,很快就能知道你在听什么。对于歌曲,阅读细菌。“对于[新目录]你可能只需要十分之一的排序量,”芬恩说。一旦指纹与数据库中的记录相匹配,科学家就可以确定他们正在观察的物种。过去这项艰巨的任务很快就能完成,帮助更有效地识别样本中的细菌(或缺乏细菌)。最终,希望数据库能够覆盖肠道中发现的每一种细菌,但这也带来了一些重大挑战。芬恩解释说:“我们估计(数据库)可能占所有肠道细菌的20%,但我们说,有很多警告。目前的数据库比以前的项目大50%,包含了大多数常见细菌,但仍被认为有很多缺失。”芬恩解释说:“我们的数据集确实存在偏差,因为它往往来自北美和欧洲。”他还指出,样本量非常小,只测试了20个粪便样本。要想知道具体包括什么也很困难。“你的肠道里总是有很多细菌,有些细菌只是通过肠道。也许是你吃的食物,”他说。“所以我们需要更多的样本来建立一个完整的图像。希望有一天,个别种类的细菌可以被包装成药丸,这是治疗需要细菌刺激的病人的一种更安全、更快的方法。“关于你的肠道、你的微生物群在维持健康方面的重要性,媒体上有很多报道,还有许多不同的疾病是由肠道细菌引起的。这项工作正在形成一个获取细菌的平台,我们可以利用这个平台开始详细地解决关于细菌在做什么的问题。”
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